学校2000年开始设立心理咨询室，心理咨询室是具体负责实施心理健康教育和心理咨询的机构，挂靠学工处，具体工作由学工处负责指导。为了与时俱进，适应新形势下大学生成长和心理健康教育的需要，2018年心理咨询室改扩建，并更名为“运河高等师范学校大学生心理健康教育与咨询中心”。

  中心拥有超过400平米的场地，包含咨询接待室、心理宣泄室、音乐放松室、沙盘游戏室、团体辅导和个别辅导室等功能用房。中心配备了一支专兼任心育教师队伍，其中叶慎花、金英、姚贝贝三位老师拥有人社部二级心理咨询室资质，刘玉老师拥有人社部高级心理咨询室资质，其余还有4位老师拥有徐州市中级心理咨询师证。

  我校心理健康教育与咨询中心的主要职责有：1、负责制定心理健康教育中心的工作计划；2、负责心理健康知识的宣传和普及工作；3、负责建立和完善学生心理档案，并撰写分析报告；4、负责开展个别和团体心理咨询和辅导；5、负责开展心理咨询工作的研讨和交流；6、负责心理热线的正常开通和预约接待；7、负责网络心理咨询的建立和开展工作； 8、负责对心理异常情况的跟踪和心理危机的干预； 9、负责组织、安排全院心理健康教育中心工作人员的学习和培训工作；10、负责对班主任等学工一线工作者的心理健康教育培训；11、负责对校心理社团的指导工作；12、负责开设心理健康教育必修课及选修课。